По-перше, мандарини слід із великою обережністю давати дітям. Опасність полягає у яскраво виражених алергенні властивості фрукта. По-друге, виключити мандарини з раціону рекомендується людям, що страждають на виразкову хворобу шлунка та двенадцятипалої кишки, а також гастритом із підвищеною кислотністю шлункового соку.

Шкірка мандаринів також не завжди безпечна. Через високий вміст ефірних олій вона протипоказана при багатьох хворобах печінки, нірок, підшлункової залози, жовчовивідних шляхів.

При цьому, шкірки мандаринів не можна споживати через хімікати, які використовують для захисту рослин від шкідників і хвороб. Тому ні їсти її, ні готувати з неї варення не рекомендується.